jan 21 2012

Até logo, e obrigado pelos peixes*

Tudo começou com uma ideia e várias influências. A ideia era escrever um blog sobre as coisas que a ciência descobria a respeito do universo, sobre pseudociências e tudo o mais...As influências vieram de blogs que comecei a ler por volta de 2008, como o "Brontossauros no meu Jardim", "Rainha Vermelha", "N-dimensional", alguns blogs que descobria no portal lusitano "Blogs de Ciência", e alguns norte americanos como o do Carl Zimmer (The Loom), do Ed Young (Not Exactly rocket science) e do biólogo evolucionista Jerry Coine (Why evolution is true?). Então as coisas começaram sem um pingo de pretensão, e com o tempo mais pessoas começaram a visitar este espaço "O amigo de Wigner" e retornavam a cada postagem nova, o que me fazia cada vez tentar atingir uma qualidade maior...

Um urso-da-água vive num grão de areia e se auto-denomina o rei do universo

Bom, tudo acaba e se ainda não acabou um dia irá, mas enquanto uma "coisa" pode se extinguir, deixando somente as lembranças, outras coisas podem mudar (ou se você preferir) evoluir! e é isto que vai acontecer com este espaço. O blog foi selecionado para fazer parte da maior rede de blogs de ciência do mundo, o Scienceblogs.com, mais precisamente o braço brasileiro da rede, o scienceblogs.com.br ao lado de, veja só, os mesmos blogs que me influenciaram para começar a escrever, mas não somente estes, outros excelentes blogs de ciência, alguns tão novos quanto este aqui, e tão excelentes quanto! o que me deixa muito feliz e ansioso para ver como vai ser daqui em diante. Então a despedida é dolorida, no sentido que este espaço aqui do blogspot vai ser desativado com o tempo, juntamente com o nome o "amigo de Wigner".

Isso requer algumas explicações, veja bem, eu tirei esse nome de um experimento mental da mecânica quântica, que tem relação com outro famoso experimento o "Gato de Schrödinger", e como sempre foi um tanto complicado explicar de forma simples, sempre pensei em mudar o nome, para não complicar tanto, e também por que ao longo do tempo os temas que mais apareciam aqui foram os ligado as ciências da vida, mais precisamente sobre evolução, enfim, como eu já utilizava um nome antigo que significa bastante para mim, por diversos motivos, em outros projetos, e como foi o primeiro nome de um blog sobre poesia da ciência (que não deu muito certo) penso que seria legal utilizá-lo novamente nesse novo caminho. Então gostaria que as mesmas pessoas que acompanharam esta saga do Amigo de Wigner, acompanhem o "novo" blog, "O jarro de moscas" que logo estará num novo endereço... Obrigado a todos... Juntem-se a mim e iremos governar a galáxia... Até o próximo post.

*Título da postagem retirado da série "Guia do mochileiro das galáxias"


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nov 19 2011

A salamandra solar

Simbiose. Um espectro de relações na qual organismos interagem e vivem juntos de forma mais íntima possível, e onde ambos podem se beneficiar ou se destruir lentamente. Em vertebrados tetrápodes um tipo de simbiose insólita já é conhecida por uma centena de anos, e é decorrente do mutualismo nada usual entre salamandras e algas microscópicas.

Aqui os embriões de salamandras convivem intimamente com algas como Oophila amblystomatis e Chlamydomonas sp. se banhando neste suco verde e fotossintetizante enquanto vão se desenvolvendo. A equipe da Universidade de Indiana em Bloomington demonstrou que a floração das algas e posterior contato com as células de embriões de salamandra se dá logo ao inicio da formação do embrião.

No detalhe em vermelho, as algas marcadas na região da cabeça do embrião. Detalhes dos ovos.

Os embriões produzem dejetos ricos em nitrogênio como a amônia e dióxido de carbono que a alga utiliza em seu metabolismo cedendo oxigênio dissolvido em troca, para os embriões. Aparentemente as algas são passadas de mãe para os filhotes, já que as algas acompanham as salamandras em toda sua vida, desde o desenvolvimento embrionário até o nascimento de novos filhotes nas fêmeas. Resta saber quais outras espécies de salamandras e outros anfíbios atingiram tal grau de simbionticidade, e se ocorreu algum troca gênica dentro deste complexo como a transferência horizontal, o que não iria me surpreender nem um pouco...

Adulto de Ambystoma maculatus

Referências:

Kerney. ryan. "Symbioses between salamander embryos and green algae" in Symbiosis. October 2011. DOI 10.1007/s13199-011-0134-2

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nov 02 2011

De bactérias púrpuras até as galáxias.

Quando um Biólogo (ainda não me graduei, mas enfim...) diz que você é bonita, não pense que é somente um elogio, daqueles que já ouviu de todos os outros e em todas as sextas (ou sábados, ou nos outros dias da semana) pois claro, nossa mente funciona através da comparação, e neste caso a comparação não se dá com as outras mulheres, de outras sextas,

sábados e outros dias da semana, mas sim com todos os outros organismos deste firmamento... E isso, tipo, é bastante coisa sabe... Eu comparo com todas as estruturas do Universo, de bactérias púrpuras do fundo do oceano a galáxias em espiral. De pandas e pessoas. De pulsares a foraminíferos... Então, leve a sério...

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set 26 2011

Sobre vermes e homens



"E, no esforço de ser homem, o verme
Escala todas as espirais da forma"

(Jun Takami)

Imagem: Mario Ciocca - New Scientist

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abr 08 2011

Regra à três

Quando estudamos a história evolutiva das espécies, suas interações ecológicas com outros indivíduos e com o meio, sua dinâmica de populações e das comunidades, podemos chegar a conclusão que uma eterna luta é travada na natureza, seja numa floresta úmida, num deserto solitário e escaldante, nas termas submarinas e ácidas ou até mesmo dentro dos nossos do corpos. Um guerra entre presa, predador, e entre indivíduos da mesma espécie, onde somente um sai vencedor...

"Não desista. Lute até o fim!"

Mas nem sempre a história é escrita dessa forma, as vezes uma trégua, é necessária para continuar a sobreviver.
O termo Simbiose, foi utilizado pelo primeira vez em 1879 pelo Micologista alemão Heinrich Anton de Bary e foi definido como "organismos diferentes vivendo juntos". Desde então o estudo dessa área veio crescendo e demonstrando que a simbiose deu origem a grandes saltos evolutivos, como o surgimento das células eucarióticas e das organelas mitocôndria e dos cloroplastos nas plantas. O ditado popular "uma mão lava a outra" vem a calhar nesse conto, mas venho aqui para falar de seres que não possuem mãos para serem "lavadas"...

Homalodisca vitripennis

O drama da vida neste teatro evolutivo que vos apresento é encenado pela cigarra Homalodisca vitripennis, e as bactérias hospedadas em seu corpo, a Baumannia cicadellinicola e Sulcia muelleri, numa espécie de "Threesome" estes organismos convivem intimamente, e quando falo de intimidade, viver dentro do corpo de outro talvez seja o máximo de intimidade que se pode alcançar. A cigarra H. vitripennis, como diversos artrópodes que convive com endosimbiontes, possui uma estrutura corporal especializada para isso, o bacterioma, onde residem os bacteriócitos, as células que protegem as bactérias, provem nutrientes, aminoácidos necessários para sua manutenção e são transmitidas maternalmente para a prole.

A dupla de endossimbiontes: Baummania (verde) e Sulcia (vermelho)

Claro que viver junto tem suas consequências, como a redução do genoma do endossimbionte, e a inabilidade de viverem separados tanto o hospedeiro quanto o hospedado, tática utilizada para exterminar insetos que muitas vezes se tornam pragas de lavouras, ou vetores de doenças, mas os benefícios desse estilo de vida, neste caso podem ser resumidos em:
A espécie Baummania sintetiza vitaminas e cofatores, enquanto a Sulcia produz aminoácidos, complementando a síntese da Baummania e provendo fonte energética para a cigarra Homalodisca, que se alimenta no xilema de algumas plantas cujo não possuem tais "mantimentos" para a sobrevivência da cigarra.
Neste regra á três, diferente da música do Vinícius de Moraes "regra três", o menos não vale mais...

Referências:

http://www.pnas.org/content/104/49/19392.full
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16729848
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC368156/
Letra da música Regra Três

Imagens: Aqui e daqui.

Este texto já foi publicado no blog Biologia em Ciência e Evolucionismo.ning

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mar 20 2011

O quarto Domínio da Vida

Sobre o artigo da equipe de Jonathan Eisen da UC Davis sobre evidências de um quarto Domínio da Vida. (aqui uma nota explicativa bem detalhada no blog do Biólogo Evolutivo Jonathan Einsen, autor do artigo.) As evidências vieram das amostras do projeto de Craig Venter que procura coletar água do mar, em seu iate, para posteriormente realizar análises metagenômicas com os organismos encontrados, utilizando marcadores moleculares como as subunidades de ARN.

(Bacon, Lettuce, and Tomato, a convergência "maneira" ou algo do tipo)

O que foi encontrado, ao construir árvores filogenéticas destes organismos, foi um padrão de ramificação "novo" que dá a idéia de que alguns vírus gigantes, como o Mimivirus e outros, possam representar este 4° Domínio da vida. Traz a tona a velha questão, que pensei estar encerrada, de estas entidades genéticas serem "vivas" ou não...

Carl Zimmer no blog "The Loom" discute a respeito deste artigo também.

Referências:

Wu D, Wu M, Halpern A, Rusch DB, Yooseph S, et al. 2011 Stalking the Fourth Domain in Metagenomic Data: Searching for, Discovering, and Interpreting Novel, Deep Branches in Marker Gene Phylogenetic Trees. PLoS ONE 6(3): e18011. doi:10.1371/journal.pone.0018011

Imagem: Abstruse goose

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mar 17 2011

As chuvas de abril em Titã...

ResearchBlogging.org
No momento que escrevo este texto, chove na noite de Porto Alegre... Lá em Titã, a segunda maior exolua do nosso sistema solar, um dos satélites naturais do deslumbrante planeta Saturno, aquele exibido com seus anéis, também está chovendo. Uma chuva alienígena, escura e densa, mas que a boniteza deste fenômeno, antes único no nosso sistema solar, o ciclo de chuvas, algo tão vulgar e comum em muitas regiões aqui na Terra, não passe despercebido por nós...

Nuvens equatoriais em Titã.

O clima em Titã é similar ao da Terra, há ventos intensos que ajudam a moldar a sua superfície, formando dunas, lagos, rios, e talvez até oceanos de metano ou etano. Aparentemente há estações definidas em Titã, cada uma durando em torno de 7 anos terrestres.

Comparação de tamanho entre a Terra, Titã e a nossa Lua.

Em artigo publicado ontem na revista Science, E.P Turtle et al. reportam a ocorrência do início de temporada das chuvas e teorizam a respeito do sistema atmosférico de precipitação comparado com o da Terra.

"Padrão simplificado de circulação da atmosfera e os padrões de precipitação em Titã e da Terra. A maior parte da precipitação ocorre na ZCIT (Zona de convergência intertropical), onde o ar sobe como resultado da convergência dos ventos de superfície das direções norte e sul. A ZCIT Titã era anteriormente perto do pólo sul (A), mas está atualmente em seu caminho para o pólo norte (B). A migração sazonal da ZCIT na Terra é muito menor (C e D)."

No dia 8 de Julho de 2009, a sonda Cassini observou a reflexão especular do Sol, no espectro do infravermelho de um dos lagos desta Lua, o Jingpo Lacus, que existe na região polar de Titã, logo após esta área emergir de 15 anos da escuridão invernal...
Penso num futuro distante, onde os alienígenas na praia seremos nós, debaixo de nuvens chuvosas, a lembrar de forma saudosa da chuva de início de outono de Porto Alegre (ou qualquer outra cidade) na Terra, e quem sabe navegar em tais lagos e oceanos...

"...all I ask is a tall ship and a star to steer her by". John Masefield (1878-1967).

Referências:

LUNINE, J., STEVENSON, D., & YUNG, Y. (1983). Ethane Ocean on Titan Science, 222 (4629), 1229-1230 DOI: 10.1126/science.222.4629.1229
E. P. Turtle et Al. (2011). Rapid and Extensive Surface Changes Near Titan’s Equator: Evidence of April Showers. Science. 18 March 2011: 331 (6023), 1414-1417. [DOI:10.1126/science.1201063]

Sciencenow

Página da Wikipédia sobre Titã

Poema "Sea fever" de John Masefield

À respeito da ultima postagem sobre as supostas bactérias extraterrestres, uma pequena matéria e entrevista sobre o fechamento do laboratório de Astrobiologia da Universidade de Cardiff na Inglaterra, onde o diretor era o físico Chandra Wickramasinghe, um dos resenhistas do polêmico artigo e editor da revista onde ele foi publicado, mais infos. em breve...

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mar 07 2011

Sobre bactérias alienígenas...

Tomei conhecimento através do "Gene Repórter" do Roberto Takata sobre o artigo do pesquisador da NASA/Marshall Space Flight Center, Richard B. Hoover publicado on-line e de acesso livre no "Journal of Cosmology", sobre a descoberta de estruturas nos meteoritos Alais, Ivuna e Orgueil CI1 , que possuem semelhança com uma uma bactéria gigante, a Titanospirillum velox e diversos outros microorganismos "espiralados".

Comparação entre os supostos microfósseis de Hoover e a bactéria Titanospirillum velox.

Se a descoberta fosse da área da palentologia, seria algo usual, mas a conclusão de Hoover vai muito além, pois ele alega que os microfósseis sao indígenos do meteorito, e não representam uma contaminação de organismos terráqueos atuais ou extintos... Encurtando a história, a conclusão do artigo é que estas estruturas representam entidades biológicas extraterrestres que pegaram carona no meteorito, possivelmente de uma exolua, ou de outros planetas!, Baseado em fotografias por métodos avançados e sensíveis (microscopia eletrônica) e por comparação com organismos como a já citada bacteria sulfurosa, das estruturas para reprodução, fixação de nitrogênio e outras atividades metabólicas de microorganismos conhecidos.

Ilustração belíssima da Titanospirillum velox.
Realmente, nao tenho "expertise" suficiente para julgar, mas a máxima de Carl Sagan, talvez seja a forma mais simples de expressar em poucas palavras como funciona o método científico: "Alegações extraordinárias requerem evidências extraórdinárias", frase que já virou um "meme" ou um mantra de como os cientistas testam, validam ou refutam suas hipóteses.
Alem das estruturas alienígenas, (e de fato são) varios compostos orgânicos como hidrocarbonetos e aminoácidos foram detectados nos meteoritos, todos apontando uma origem extraterrena (e mais uma vez, penso que ainda é cedo para concluir a respeito dos microfósseis)... Entre os dias 7 e 10 de março comentários a respeito do artigo irão ser postados no site da revista.

Uma das metas da NASA e da ESA (agência espacial européia) é futuramente aterrissar em Europa, uma das luas de Júpiter e coletar amostrar do suposto oceano líquido ou congelado, e averiguar se existem assinaturas biológicas nestes lugares alienígenas. Só assim para confirmar a hipótese de vida fora da Terra, se realmente tivermos acesso a tais organismos hipotéticos...Uma idéia interessante sugerida no artigo é a respeito das colorações na superfície da lua Europa, que poderiam ser em decorrência da atividade biológica alienígena, como alguns microorganismos fazem aqui na Terra, o exemplo da "neve de melancia" causada pelo Protista Chlamydomonas nivalis.

"Neve de melancia".

Referências:
Gene Reportér

Journal of Cosmology

"Titanospirillum velox: A huge, speedy, sulfur-storing spirillum from Ebro Delta microbial mats."PNAS.

Imagens:

Journal of Cosmology
Eco-time
Palomar
Nasa.gov

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mar 01 2011

O Guia do Mochileiro dos Genomas

ResearchBlogging.org
Solidão. Ou é momentânea, ou ilusória. Nunca estamos sozinhos. Dentro de nós existem mais bactérias que gotas da água num dia chuvoso de verão. Algumas nos acompanham do nascimento até o funeral, outras vamos adquirindo através da comida, da respiração e do toque de outra pele... Para o bem e para o mal, convivemos com elas. Algumas são organismos caroneiros, no melhor estilo "On the Road" do escritor Beat, Jack Kerouac. E talvez, a mochileira oficial na estrada da história da vida na Terra é a espécie Wolbachia pipientis, uma Rickettsiacea.

Uma célula de inseto hospedando algumas Wolbachias (os círculos). A dominatrix da Biosfera
Uma bactéria endossimbionte obrigatória, ou seja que não é possível cultivá-la ou a remover de seu hospedeiro sem causar alguma alteração fisiológica no mesmo. Extremamente sexista (se as feministas fossem escolher algum mascote seria esta a ideal) onde na sua presença a proporção de machos e fêmeas é alterada (normalmente fica em torno de 50%) e ainda são mestras na manipulação sexual do hospedeiro. Elas pegam carona nos óvulos das fêmeas, assim sendo transmitidas a sua prole.

Wolbachia está em seus óvulos, matando os seus machos!

Os principais efeitos no hospedeiro são: morte dos machos na prole, partenogênese (quando não há necessidade de fusão de gametas do sexo oposto), ou seja o animal teria somente uma mãe e nenhum pai, transformação de machos em fêmeas e incompatibilidade citoplasmática (quando uma estirpe, um tipo de bactéria da fêmea não é compatível com a estirpe do macho) o que leva a morte de praticamente toda a prole do acasalamento.
É o parasita mais bem sucedido de toda a biosfera, praticamente 70% dos invertebrados possuem Wolbachias em seus corpos, de moscas da fruta, aranhas, escorpiões, crustáceos, borboletas e alguns vermes nematóides, o que nos traz um paradoxo, pois se ela altera tanto a "sexualidade" dos seus hospedeiros, causando um genocídio de machos, por que esta relação simbiótica é tão persistente?

Algumas das manipulações na fecundação entre seus hospedeiros.

Bom, foi descoberto que em algumas espécies de Drosophilas (as moscas da frutas) que estas estão protegidas contra alguns vírus de RNA, na presença destes endossimbiontes, o que torna "incerto" o conceito de parasitismo e mutualismo, não sendo algo eternamente estático, mas sim um conceito que possui uma certa plasticidade.
Não bastasse elas pegarem carona nos ovos e filhotes de outros organismos, existe a evidência dramática, onde em pelo menos uma espécie da mosca hawaiana Drosophila ananassae, possui o genoma inteiro da Wolbachia, praticamente 1 milhão de pares de bases, incrustado em seu cromossomo 2, além de pedaços de outros genes da bactéria nos genomas de vespas, besouros e nematóides através da transferência horizontal gênica. Melhor carona que esta é impossível!
Alguns teóricos especulam que a Wolbachia poderia dar origem a uma nova organela, da mesma forma que a mitocôndria e o cloroplasto surgiram na teia da vida, mas num futuro distante...

A flecha indica o genoma da wolbachia em verde, no cromossomo politênico de Drosophila.

Agora imagine se existisse algum organismo que assume o controle da vida sexual dos seres humanos, e manipulasse a razão macho/fêmea dando ênfase ao nascimento somente de mulheres! Um tema abordado na HQ "Y o último homem", isso se sobrassem homens para deslumbrar tal mundo... Mas deixaremos estas últimas palavras para os escritores de ficção científica...

Referências:

Zimmer, C. (2001). Wolbachia: A Tale of Sex and Survival Science, 292 (5519), 1093-1095 DOI: 10.1126/science.292.5519.1093

Teixeira, L., Ferreira, �., & Ashburner, M. (2008). The Bacterial Symbiont Wolbachia Induces Resistance to RNA Viral Infections in Drosophila melanogaster PLoS Biology, 6 (12) DOI: 10.1371/journal.pbio.1000002

Hotopp, J., Clark, M., Oliveira, D., Foster, J., Fischer, P., Torres, M., Giebel, J., Kumar, N., Ishmael, N., Wang, S., Ingram, J., Nene, R., Shepard, J., Tomkins, J., Richards, S., Spiro, D., Ghedin, E., Slatko, B., Tettelin, H., & Werren, J. (2007). Widespread Lateral Gene Transfer from Intracellular Bacteria to Multicellular Eukaryotes Science, 317 (5845), 1753-1756 DOI: 10.1126/science.1142490

Imagens: infelizmente perdi as referências de algumas...

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fev 27 2011

Uma corda sobre um abismo...


"O homem é uma corda estendida entre o animal e o super-homem- uma corda sobre um abismo" (Nietzsche, FW., 1995 [1885]: 31).



Não há uma linha bem definida separando os outros animais de nós. E se é existe é tênue o suficiente para nos confundir o que é do "animal" ou o que faz parte da humanidade. Formigas constroem túneis complexos debaixo dos nossos pés, e nós construímos edifícios... Qual é a diferença?

O abismo seria o tempo, e a corda seria os outros animais... Somente.

A pausa para o Café foi demorada, mas estamos de volta...

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